Zbiory grafiki, rysunku, malarstwa i rzeźby obejmują sztukę polską od końca XVIIIw. W kolekcji malarstwa znajdują się dzieła najwybitniejszych twórców XIX i XXw. W kolekcji sztuki XXw. znajdują się znaczące zespoły prac kolorystów polskich i Grupy Krakowskiej. Zbiory Działu Sztuki Dawnej obejmują kolekcje rzeźby, malarstwa, grafiki, rysunków, rzemiosła artystycznego oraz militariów z okresu od wczesnego średniowiecza do II wojny światowej. Kolekcja rzeźby średniowiecznej obejmuje przede wszystkim dzieła z obszaru Pomorza Zachodniego. Liczne zbiory zabytków archeologicznych obejmujące kilkadziesiąt tysięcy pozycji inwentarzowych.
Muzeum jest obecnie największą instytucja kultury w województwie Zachodniopomorskim. Klasycznym muzeum wielodziałowym, sprawującym opiekę nad ponad 150000 obiektami, wśród których są dzieła sztuki dawnej oraz współczesnej, zabytki archeologiczne, nautologiczne, etnograficzne, a także cenne numizmaty. W szczecińskim Muzeum znajduje się także największy w Polsce zbiór świadectw kultury materialnej krajów pozaeuropejskich. Muzeum, koncentrujące swoje zainteresowania przede wszystkim na tematyce pomorskiej i bałtyckiej, współtworzy tożsamość regionalną i narodową Pomorza Zachodniego.